Эркабой Машарипов родился 15 марта 1948 года в селе Хамза Шайх Ташхаузской области Туркменистана в крестьянской семье. В 1967 году окончил среднюю школу в этом же селе. После школы начал трудовую деятельность в качестве художника-оформителя в музыкально-комедийном театре имени Огахий в городе Ургенч. Он стал учеником заслуженного деятеля искусств Узбекистана Лолахон Абдуллаевой, у которой постигал тайны изобразительного искусства.
В 1968–1970 годах проходил службу в армии. После возвращения из армии в 1970–1971 годах вновь продолжил работу в театре имени Огахий в Ургенче.
Благодаря полученным знаниям от своих наставников и по их рекомендации был принят в Ташкентское художественное училище имени Бенкова, где продолжил изучение живописи у опытных педагогов. В 1975 году успешно окончил училище и вернулся на родину — в село Хамза Шайх Ташхаузской области Туркменистана, где продолжил работу в качестве художника-оформителя в расположенном в районном центре Дворце культуры.
Опираясь на полученные знания, навыки и опыт от многочисленных наставников, Эркабой Машарипов принимает решение поступить в Ташкентский театрально-художественный институт имени Островского. В 1976 году он становится студентом отделения станковой живописи. В течение шести лет обучения он активно участвовал в республиканских художественных выставках. В 1982 году успешно защитил дипломную работу под названием «Наблюдение» и начал создавать серию произведений, продолжая своё творческое развитие.
В короткие сроки он создал такие работы, как «Новый путь», «Первый караван» и «Мои односельчане», а также ряд портретов своих современников и пейзажей родного края. В 1990 году Эркабой Машарипов был принят в Союз художников Узбекистана.
В 1995–1997 годах он организовал кружок изобразительного искусства в Ташкентском государственном институте ирригации и мелиорации и начал обучать интересующихся юношей основам изобразительного искусства. В 1987–1989 годах преподавал по своей специальности в ташкентском техникуме культурного просвещения. В 1989 году был принят на должность преподавателя кафедры рисунка в театрально-художественном институте имени Манона Уйгура.
Во время своей педагогической деятельности активно участвовал в республиканских и международных художественных выставках. Эркабой Машарипов принимал участие во множестве республиканских и международных конкурсов, где неоднократно занимал призовые места. На конкурсе, посвящённом 1000-летию Алпомыша, он стал победителем, создав образ Алпомыша. Также участвовал в конкурсе, посвящённом 800-летию Джалолиддина Мангуберди, представив одноимённую работу. В конкурсе, посвящённом жизни и деятельности Амира Темура, создал картины «Победа Амира Темура над Тохтамышханом» и «Амир Темур и его младший сын Умаршайх Мирзо Бахадир». Эти произведения на сегодняшний день хранятся в Музее истории Темуридов.
В 2003 году за участие в конкурсах, посвящённых историческим событиям, и за создание исторических произведений Эркабой Машарипов был удостоен ордена «Трудовая слава».
В настоящее время Эркабой Машарипов продолжает свою трудовую деятельность и обучает многих студентов основам изобразительного искусства.